Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnk2O54967 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnk2O54967 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms