Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarce1O54941 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarce1O54941 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms