Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfkbieO54910 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbieO54910 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbieO54910 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms