Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limk2O54785 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limk2O54785 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limk2O54785 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Limk2O54785 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Limk2O54785 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Limk2O54785 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Limk2O54785 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Limk2O54785 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Limk2O54785 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms