Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf12O35738 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf12O35738 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf12O35738 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms