Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppfibp2O35711 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfibp2O35711 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppfibp2O35711 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms