Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar2O35664 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifnar2O35664 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar2O35664 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms