Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn6O35646 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn6O35646 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn6O35646 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn6O35646 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn6O35646 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn6O35646 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn6O35646 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn6O35646 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn6O35646 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn6O35646 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn6O35646 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn6O35646 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn6O35646 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn6O35646 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn6O35646 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms