Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn1mwO35599 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Opn1mwO35599 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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