Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx1aO35526 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx1aO35526 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms