Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppef2O35385 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppef2O35385 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms