Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Abcc1O35379 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Abcc1O35379 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Abcc1O35379 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Abcc1O35379 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Abcc1O35379 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms