Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pkd2O35245 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pkd2O35245 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Pkd2O35245 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms