Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn9O35239 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ptpn9O35239 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Ptpn9O35239 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Ptpn9O35239 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn9O35239 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn9O35239 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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