Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kifc3O35231 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Kifc3O35231 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kifc3O35231 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kifc3O35231 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Kifc3O35231 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms