Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn4O35054 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn4O35054 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn4O35054 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn4O35054 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn4O35054 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn4O35054 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn4O35054 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn4O35054 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn4O35054 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn4O35054 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn4O35054 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn4O35054 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cldn4O35054 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn4O35054 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn4O35054 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms