Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sypl1O09117 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl1O09117 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl1O09117 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sypl1O09117 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sypl1O09117 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms