Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncoa3O09000 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncoa3O09000 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ncoa3O09000 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncoa3O09000 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms