Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efna5O08543 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efna5O08543 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Efna5O08543 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna5O08543 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms