Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl4M0QW46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl4M0QW46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms