Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3739L7N296 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3739L7N296 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3739L7N296 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms