Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc191J3QQ27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc191J3QQ27 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms