Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8298J3QPI0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8298J3QPI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8298J3QPI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8298J3QPI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms