Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2035J3QP87 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2035J3QP87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Gm2035J3QP87 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm2035J3QP87 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm2035J3QP87 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Gm2035J3QP87 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2035J3QP87 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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