Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3415J3QMS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3415J3QMS8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms