Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm20873J3QMQ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20873J3QMQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm20873J3QMQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm20873J3QMQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm20873J3QMQ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm20873J3QMQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20873J3QMQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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