Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3336J3QMQ6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms