Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcf11G3X9Z4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pcf11G3X9Z4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcf11G3X9Z4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcf11G3X9Z4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms