Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r58G3X9U3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms