Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf148G3X9R7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf148G3X9R7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms