Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
1700067P10RikG3X8U2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700067P10RikG3X8U2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms