Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-1G3UXB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-1G3UXB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-1G3UXB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms