Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp72F8VQC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms