Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5160F8VPN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5160F8VPN3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms