Protein–RNA interactions for Protein: F7BY56

Gm8138, Predicted gene 8138 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8138F7BY56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8138F7BY56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8138F7BY56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8138F7BY56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms