Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Rarres1F6ZIS7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rarres1F6ZIS7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rarres1F6ZIS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms