Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
D430041D05RikF6ZGR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
D430041D05RikF6ZGR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms