Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm2564F6Z9S8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm2564F6Z9S8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2564F6Z9S8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm2564F6Z9S8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm2564F6Z9S8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2564F6Z9S8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms