Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8247F6VRJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms