Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plekhg1F6S200 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Plekhg1F6S200 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Plekhg1F6S200 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms