Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl17F6R5P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms