Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Herc6F2Z461 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc6F2Z461 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms