Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf165E9QAU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Rnf165E9QAU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Rnf165E9QAU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Rnf165E9QAU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf165E9QAU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Rnf165E9QAU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Rnf165E9QAU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Rnf165E9QAU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rnf165E9QAU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Rnf165E9QAU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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