Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod3E9QA62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmod3E9QA62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms