Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc74aE9Q9U8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc74aE9Q9U8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms