Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp17lbE9Q9U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp17lbE9Q9U0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp17lbE9Q9U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms