Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdhr2E9Q7P9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdhr2E9Q7P9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdhr2E9Q7P9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdhr2E9Q7P9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms