Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Setd2E9Q5F9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Setd2E9Q5F9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Setd2E9Q5F9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms