Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b2E9Q3E1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh3b2E9Q3E1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms