Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tarbp1E9Q368 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tarbp1E9Q368 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tarbp1E9Q368 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms